Lobezno llega a Japón para encontrarse con un viejo amigo cuya vida salvó hace años y se ve envuelto en una conspiración que involucra a yakuza y mutantes.

Ambientada en la década de los 70, los miembros de la famosa Patrulla X tendrán que evitar un futuro apocalíptico en el que los mutantes luchan por sobrevivir en campos de concentración controlados por los temibles Centinelas. Para ello, los héroes del universo Marvel deberán unificar sus fuerzas dejando a un lado la creciente enemistad de los bandos liderados por Charles Xavier y Magneto. Trask Industries, la empresa encargada de crear a estos gigantescos cazamutantes, será el origen de todos sus problemas. Tan sólo viajando en el tiempo podrán impedir la masacre que se avecina. ¿Serán capaces nuestros héroes de derrocar a la multinacional y evitar así el exterminio de su especie?

Wade Wilson, tras ser sometido a un cruel experimento científico, adquiere poderes especiales que le convierten en Deadpool. Armado con sus nuevas habilidades y un retorcido sentido del humor tratará de dar caza al hombre que casi destruye su vida.

Los X-Men son seres que poseen increíbles y peligrosos poderes que derivan de extraordinarias mutaciones genéticas. Bajo la tutela del profesor Xavier, sus poderes son puestos al servicio del bien. Ahora deberán proteger al mundo de Magneto.

Un apático Wade Wilson se afana en la vida civil tras dejar atrás sus días como Deadpool, un mercenario moralmente flexible. Pero cuando su mundo natal se enfrenta a una amenaza existencial, Wade debe volver a vestirse a regañadientes con un Lobezno aún más reacio a ayudar.

Situada 17 años antes, narra los inicios del arma X y la forma en la que Wolverine se convirtió en mutante. Logan, convertido en un mutante que se hace llamar Wolverine, y que es capaz de sacar unas afiladas garras y de una fuerza y agilidad sobrehumana, ultima su venganza contra Victor Creed, culpable de la muerte de su novia. Mientras tanto, otros mutantes se acogen al programa X para unir sus fuerzas.

Los X-Men se enfrentan a su enemigo más poderoso: uno de sus miembros, Jean Grey. Durante una misión de rescate en el espacio, Jean casi muere al ser alcanzada por una misteriosa fuerza cósmica. Cuando regresa a casa, esa radiación la ha hecho más poderosa, pero mucho más inestable. Mientras lucha con la entidad que habita en su interior, Jean desata sus poderes de formas que no puede controlar ni comprender. Jean cae en una espiral fuera de control haciendo daño a aquellos que más ama y empieza a destruir los lazos que mantienen unidos a los X-Men

El gobierno humano desarrolla una cura para las mutaciones, y Jean Grey se convierte en una persona incontrolable más oscura llamada Fénix que se alía con Magneto, provocando una escalada en una batalla total por los X-Men.